后来他被贬为中大夫，居家写作了《灾异之记》。

这时辽东高帝庙发生火灾，主父偃嫉妒他，就窃取了他的书上奏天子。

天子召集众儒生把书拿给他们看，儒生们认为其中含有指责讥讽朝政之意。

董仲舒的学生吕步舒不知道这是自己老师的著作，认为它愚蠢至极，于是把董仲舒交法官论罪，判处死刑，但是皇上降诏赦免了他。

于是董仲舒始终不敢再讲论灾异之说。

董仲舒为人廉洁正直。

这一时期朝廷正用兵向外排除四方边境内外少数民族的侵扰，公孙弘研究《春秋》成就不及董仲舒，但是他行事善于迎合世俗，因此能身居高位做了公卿大臣。

董仲舒认为公孙弘为人阿谀逢迎。

公孙弘憎恨他，就对皇上说：“只有董仲舒可以担当胶西王的国相。”

胶西王为人狠毒暴戾，但是一向听说董仲舒有美德，也很好地礼遇他。

董仲舒害怕居官日久会惹祸上身，就称病辞官回家。

直至逝世，他始终不曾营治私产，而一心以研究学问写作论著为本职。

所以自汉朝开国以来历经五朝，期间只有董仲舒对《春秋》最为精通，名望甚高，他师承传授的是《春秋》公羊学。

胡毋生，是齐郡人。

孝景帝时拜为博士，后因年老返归故里讲授《春秋》。

齐地解说《春秋》的人很多受教于胡毋生，公孙弘也受过他的教诲。

瑕丘人江生研究《春秋》谷粱学。

自从公孙弘受到重用，他曾收集比较了谷粱学和公羊学的经义，最后采用了董仲舒所传授的公羊氏的学说。

董仲舒的弟子中有成就的人是：兰陵人褚大，广川人殷忠，温人吕步舒。

褚大官至粱王国相。

吕步舒官至长史，手持符节出使去决断淮南王刘安谋反的罪案，对诸侯王敢于自行裁决，而不加请示。

他根据《春秋》经义公正断案，天子都认为很对。

弟子中官运通达的，做到了大夫之职；谒者、掌故的则有百余人。

而董仲舒的儿子和孙子也都因精通儒学做了高官。